Tahun 1997 PS PDS Patologi Klinik FKUB sudah melaksanakan proses belajar mengajar dengan 2 residen titipan dari PS PDS Patologi Klinik FK universitas Airlangga yang menjalani stase pertama. Tahun 1998 PS PDS Patologi Klinik FKUB resmi berdiri berdasarkan SK Dikti nomor: 01/DIKTI/Kep/1998 tertanggal 05 Januari 1998 dan menerima 2 residen baru. Adapun yang menjabat KPS pada waktu itu adalah dr. Harijanto Prawiro Husodo, SpPK(K) dan SPS dr. Prasetyo Aji, SpPK(K), dengan staf pengajar sebagai berikut:
– Laboratorium Patologi Klinik
- dr. Harijanto Prawiro Husodo, SpPK(K)
- dr. Prasetyo Aji, SpPK(K)
- dr. Budiman, SpPK(K)
- dr. Hartojo, SpPK(K)
- dr. Ati Rastini retno Indrati, SpPK(K)
- dr. Tinny Endang Hernowati, SpPK(K)
- dr. Anik Widijanti, SpPK(K)
- dr. Sri Oemirin, SpPK(K)
- dr. Daniel Boentoro Hadiwidjaja, SpPK
– Laboratorium Mikrobiologi
- dr. Sumarno, SpMK
- dr. Sanarto Santoso, SpMK
- dr. Noorhamdani A.S., SpMK
– Laboratorium Parasitologi
- dr. Sudjari, SpParK
- dr. Aswin D. Baskoro, SpParK
- dr. Teguh Wahju Sardjono, SpParK
Ilmu Patologi Klinis (PK) mulai diperkenalkan di Indonesia pada akhir tahun 1955. Ketika itu Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (FKUI) di Jakarta mulai menerapkan kurikulum baru yang merupakan hasil kerjasama (afiliasi) antara FKUI dengan University of California Medical School. Salah satu perubahan adalah diperkenalkannya Ilmu Patologi Klinis. Pada tahun 1978 beberapa Pendidikan Spesialis diakui sebagai Pendidikan Strata dua di bawah Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia, Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi, sedangkan Program Pendidikan Spesialis Patologi Klinis dan Patologi Anatomi baru diakui tahun 1980 dan pada tahun tersebut baru dimulai pendidikan secara terstruktur berdasarkan Buku Katalog Program Studi Patologi Klinis yang dibuat pada rapat antara Kelompok Program Patologi Klinis, Anatomi dan Konsorsium Ilmu Kedokteran.
Pada awalnya hanya terdapat 5 pusat pendidikan program patologi klinis yakni Fakultas kedokteran (FK) USU,UI, UNPAD, UNAIR, dan UNHAS. Di tahun 1986, FK UGM turut mendirikan bagian patologi klinis. Namun dikarenakan permintaan dari kementrian kesehatan untuk memenuhi kebutuhan pelayanan di rumah sakit, maka perhimpunan profesi Patologi Klinis menambah 4 pusat pendidikan (pusdik) salah satunya adalah FKUB pada tahun 1998. Pada tahun 1998 Fakultas Kedokteran melalui Departemen/SMF PK FKUB-RSSA telah menyelenggarakan program studi spesialis patologi klinis secara penuh.
Tanggal 5 Januari 1998 Dikti secara resmi mengeluarkan surat keputusan pembentukan program studi dokter spesialis I Patologi Klinis bersamaan dengan 3 pusat pendidikan kedokteran lainnya. Dengan ketetapan tersebut PS PDS Patologi Klinis (PK) menjadi salah satu program studi pada Departemen Spesialis dan sub-spesialis. Penyelenggaraan PS PDS PK didukung oleh 12 staf pengajar yang terdiri dari enam staf dari departemen Patologi Klinis, dua staf pengajar dari departemen parasitologi, dua staf pengajar dari departemen Ilmu penyakit dalam, dan dua staf pengajar dari departemen ilmu kesehatan anak.