Berdirinya Prodi IKFR FKUB merupakan hasil pengembangan dari Pelayanan Rehabilitasi Medik di RSUD Dr Saiful Anwar dimulai pada tahun 1980 yang dilayani 2 orang dokter umum, beberapa fisioterapis dan seorang prothesis orthosis. Tenaga Spesialis Rehabilitasi Medik di RSUD Dr. Saiful Anwar baru ada dimulai pada tahun 1992 kemudian secara bertahap bertambah sehingga saat ini berjumlah sebanyak 9 orang dokter Spesialis Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi. Perubahan nama Spesialis Rehabilitasi Medik menjadi Spesialis Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi berdasarkan keputusan muktamar IDI tahun 2009 di Palembang.
Kuliah Rehabiltasi Medik di FKUB diberikan untuk mahasiswa S1 di FKUB dimulai sejak tahun 1995 dan Pendidikan profesi dokter dimulai sejak tahun 2009 sampai saat ini. Pada awalnya Pendidikan profesi dokter di laboratorium Ilmu Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi diberikan selama 1 minggu dan sejak 2012 menjadi 2 minggu. Hal ini disesuaikan agar pendidikan profesi dokter dapat mencapai Standar Kompetensi Dokter Indonesia. Dengan memperhatikan perkembangan IKFR yang sangat pesat, dan kebutuhan masyarakat untuk mendapat pelayanan rehabilitasi medik juga semakin meningkat. Didukung dengan adanya Pendidikan IKFR S1 Kedokteran dan profesi dokter, kecukupan tenaga pendidik, serta fasilitas pelayanan rehabilitasi medik yang memadai,maka pada tahun 2013 laboratorium Ilmu Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi mengajukan untuk dijadikan Prodi IKFR FKUB. Pengajuan ini mendapat dukungan penuh dari pimpinan FKUB maupu RSUD. Dr. Saiful Anwar Malang, sehingga pada tahun 2018 berdasarkan SK Kemenristek-Dikti No. 112/KPT/I/2018 tentang Izin Pembukaan Prodi Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi FKUB maka tanggal 02 Februari 2018 telah resmi dibuka Prodi Ilmu Kedokteran Fisik dan Rehabilitasi FKUB.